La economía del departamento del Guainía, gira alrededor de los servicios, especialmente gubernamentales, y de las actividades extractivas. Dentro de ellas, quizá la más importante sea la explotación de la fibra de palma de chiquichiqui, en las proximidades de los ríos Atabapo, Inírida y Negro, con la cual se fabrican escobas y algunas artesanías. La explotación de esta palma, sin la correspondiente resiembra, infortunadamente amenaza con la desaparición, no solo de la especie, sino que con ella, la de esa fuente de ingresos. En los últimos veinte años, el descubrimiento de los yacimientos auríferos de las serranías del Naquén y Caranacoa, han generado una inesperada migración hacia esos territorios, en la búsqueda de una rápida fortuna y ello ha causado desequilibrios y conflictos sociales, especialmente con los indígenas y los colonos asentados en el departamento desde tiempo atrás. Otras fuentes tradicionales de subsistencia de los habitantes del Guainía, son la caza y la pesca artesanal.